Pendirian Program Studi Magister Ilmu Kedokteran Gigi (PS MIKG) dimulai sejak tahun 1998 dengan masa studi 4 semester dan hingga kini telah menghasilkan lulusan yang tersebar di seluruh Indonesia dan bekerja sesuai dengan bidang ilmu. Izin penyelenggaraan PS MIKG pada Universitas Trisakti sesuai Keputusan Dirjen Dikti No. 370/DIKTI/Kep/1998 tanggal 14 Oktober 1998. Dalam menghadapi persaingan di era globalisasi, baik bidang informasi, industri maupun ilmu jasa kesehatan maka tidak ada jalan lain kecuali dengan meningkatkan kualitas sumber daya manusia khususnya di bidang Kedokteran Gigi.
Sejak tahun 2021 PS MIKG terdapat 2 (dua) peminatan yaitu Peminatan Manejemen Pelayanan Kesehatan Gigi dan Mulut dan Ilmu Kedokteran Gigi Dasar dan Klinis. Kedua unsur ini merupakan suatu kesatuan yang utuh. Jika pada pemberian pelayanan kedokteran gigi dijumpai suatu masalah yang tidak dapat dipecahkan dengan pengetahuan dan pengalaman yang tersedia, jawabannya dapat dicari melalui Ilmu Kedokteran Gigi. Sebaliknya, Ilmu Kedokteran Gigi harus mampu memberi petunjuk mengenai tindakan yang sebaiknya dilakukan dalam pemberian pelayanan kedokteran gigi. Petunjuk itu diperoleh melalui pengetahuan ilmiah yang telah tersedia atau melalui pengetahuan baru hasil riset ilmiah tentang masalah yang ditemukan dan belum terpecahkan oleh pelayanan kedokteran gigi.
Pada dasawarsa terakhir, terlihat kecenderungan di dunia ilmu kedokteran gigi internasional untuk lebih meningkatkan pemahaman terhadap Ilmu Kedokteran Gigi Dasar dan Klinis serta Manejemen Pelayanan Kesehatan Gigi dan Mulut. Hal ini diperlukan karena kebutuhan untuk memperoleh jawaban atas masalah-masalah klinis yang memerlukan riset. Sehubungan dengan  hal tersebut, salah satu tujuan PS MIKG FKG Usakti adalah sebagai pusat riset dengan mengembangkan sumber daya dan iklim akademik yang dapat mendukung karya riset untuk menghasilkan Iptek dan karya ilmiah inovatif di bidang kedokteran gigi.
Program Studi ini menyajikan 38 sks serta lama studi 4 semester. Pelaksanaan pendidikan mengutamakan kemandirian meliputi diskusi kelompok, kerja laboratorium, seminar, journal reading, publikasi karya tulis ilmiah, riset dan tesis.

Daya Tarik PS MIKG FKG Usakti:

• Status Akreditasi Program Studi: Unggul
• Status Akreditasi FKG Usakti: A
• Status akreditasi Universitas Trisakti: A
• Prospek peluang kerja: sebagai akademisi, manajer pengelolaan pelayanan medis ataupun non-medis, dunia media/jurnalisme (sebagai pengisi konten kesehatan gigi dan mulut) dan peneliti.
• Lulusan PS MIKG dapat melanjutkan ke Program Pendidikan Dokter Gigi Spesialis atau ke Jenjang S3.
• Kualitas/kualifikasi dosen: lulusan S2/Spesialis, Konsultan dan S3 dari universitas ternama di dalam dan luar negri. Memiliki 9 Guru Besar.
• Waktu kuliah: terjadwal dan terstruktur dengan jelas.
• Jenjang Pendidikan sesuai Kerangka Kualifikasi Nasional Indonesia (KKNI)
• Fasilitas gedung, ruang kuliah, ruang perpustakaan, kantin dan ruang ibadah memadai.
• Memiliki Laboratorium Penelitian: BioCore, MiCore, OpadCore dan DMTCore.

Seleksi Mahasiswa Baru PS MIKG
     Sistem rekrutmen peserta Program Studi MIKG adalah sesuai Buku Pedoman Penyelenggaraan Pendidikan Universitas Trisakti  sebagai berikut :

     Persyaratan Administrasi, calon peserta wajib menyerahkan :

• Salinan ijazah Sarjana Kedokteran Gigi / dokter gigi / sarjana rumpun ilmu Kesehatan  lulusan Perguruan tinggi Dalam Negeri yang terakreditasi.
• Untuk lulusan luar negeri, menyerahkan salinan ijazah Sarjana Kedokteran Gigi / dokter gigi luar negeri yang telah disahkan Kemenristek Dikti
• Lulus Tes Potensial Akademik, test keterampilan dan test penelaahan jurnal.
• Hasil TOEFL dengan nilai minimal 500.
• Surat keterangan berbadan sehat dan tidak buta warna.
• Rekomendasi dari dosen, atasan langsung.

Prosedur Seleksi

• Tes Akademik, menguji pengetahuan calon mahasiswa baru dalam bidang kedokteran gigi.
• Penelaahan Jurnal
• Wawancara